故事講述的是主角珍妮弗沃弗離開舊金山，來到墨西哥參與父親領導的考古發掘。到達發掘現場，珍妮弗發現父親不見蹤影，財物也被洗劫一空。父親消失前，隱藏了一些手稿，包括一本可以追溯到16世紀的書，書中記載了由特別甄選的守衛保護著的破碎成5個部分的僅存的神圣瑪雅日歷。玩家將扮演珍妮弗沃弗，任務是找到父親和珍貴的瑪雅遺跡。在父親助手拉斐爾的幫助下解開謎團，你需要考察考古地點，穿越墨西哥叢林，深入探尋紀念碑峽谷，調查來自華盛頓的線索，尋求納瓦霍友人的建議，在一系列神秘地點探尋古文明的遺跡。