《拳皇98》這款游戲是一款角色扮演類的動作格斗游戲，在游戲中玩家們將在游戲中選擇一支隊伍，開始挑戰各種隊伍。
DC版背景畫面是3D的，選人畫面、戰斗畫面和勝利算分畫面也有改動，另外隊員其它顏色的衣服（3號顏色開始到12號顏色）需要聯動Neogeo Pocket(Color)去得到。
能量系統上有了些小改動。第一個人最多有三顆能量豆，第二個人就可以有四顆，第三個人則是五顆；若是EXTRA模式，則后面的人能量槽會變短而更容易積滿。能量傳遞也由97的固定人緣關系傳遞變成了每次開機時隨機產生的心情關系傳遞，心情不好的也可以傳遞能量豆，不過要倒扣一顆（這點做得比97人性化一點）。這就使得玩家在開戰前經常按開始鍵查看心情以決定角色出場順序。
KOF98依然分為 ADVANCED MODE和EXTRA MODE兩種模式。此作中ADVANCED MODE模式能量槽數量進行了調整，根據角色對戰順序能量槽的最大數量分為三個四個以至五個，但是能量槽的繼承同樣也受到心情的影響。EXTRA MODE能量槽則依角色對戰順序逐漸縮短，集氣速度則加快。使得回避防守和進攻的切換速度大大加快。
此外指令投以及必殺技不中的話會出現硬直動作，前作中諸多BUG得到了修正，必殺技的輸入以及節奏也有所變化，游戲性加強，不過游戲平衡性上依然較為失衡，八門鶴克過于泛濫。雖然本作沒有任何故事背景，但是憑著較為完美的系統設定以及眾多的大蛇篇人物出場，也使得KOF98成為不錯的格斗游戲。
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